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胰腺癌基因的微陣列分析,2.64萬字64頁 包括外文翻譯，原創(chuàng)作品，通過查重系統(tǒng) 摘要 胰腺癌是一種相當棘手的人類癌癥，這很大程度上是因為其病情進展迅速且診斷困難，目前用于其診斷的有效的分子標志物尚少發(fā)現(xiàn)。隨著人類基因組計劃的發(fā)展，生物信息學在人類疾病相關(guān)基因的鑒別、基因與蛋白質(zhì)的表達與功能研究等方面都發(fā)揮著重要的作用。...
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胰腺癌基因的微陣列分析
2.64萬字 64頁 包括外文翻譯，原創(chuàng)作品，通過查重系統(tǒng)
摘 要
胰腺癌是一種相當棘手的人類癌癥，這很大程度上是因為其病情進展迅速且診斷困難，目前用于其診斷的有效的分子標志物尚少發(fā)現(xiàn)。隨著人類基因組計劃的發(fā)展，生物信息學在人類疾病相關(guān)基因的鑒別、基因與蛋白質(zhì)的表達與功能研究等方面都發(fā)揮著重要的作用。尤其在疾病診斷領(lǐng)域，生物基因芯片通過對全組基因表達圖譜進行數(shù)據(jù)挖掘，可以成功地將臨床表征不明或容易誤診的腫瘤準確、快速地區(qū)分開，從而為癌癥的早期診斷與及時治療做出了突出的貢獻。基因微陣列技術(shù)給發(fā)現(xiàn)癌癥早期診斷的分子標志物提供了強大的工具，它能夠在同一個水平上面對大量的基因進行檢測和分析。
胰腺癌中85%的患者是胰腺導管癌，本文便從對胰腺導管癌的基因表達進行分析下手，應(yīng)用了微陣列分析方法，希望從大量的基因微陣列數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)胰腺癌的潛在分子標志物。我們在實驗中對一個含有49個樣本的微陣列數(shù)據(jù)矩陣(其中24個是胰腺導管癌患者，另外25個為正常樣本)應(yīng)用了兩種方法進行分析。首先對樣本應(yīng)用了方差分析法，篩選出來21個具有表達差異的數(shù)據(jù)集，其對應(yīng)的基因可能作為潛在的標志基因；由于其3-D散點圖表明在這個結(jié)果中癌癥和正常細胞之間并不能完全實現(xiàn)精準的區(qū)分，因此我又采用了一種有監(jiān)督的預測算法—WV算法（weighted vote method，WV），在確定五個基因為訓練集對樣本進行預測分析時，預測精準度能達到81.6%，通過這個方法我們得到了11個具有表達差異的數(shù)據(jù)集。通過兩個方法的共同分析，以及對得到的可能的標志基因進行功能查詢，我們最終確定了EPPK1 、SCGB3A1、PLOD2和DKFZp564I1922這四個基因的表達值變化以及其調(diào)控的蛋白質(zhì)在細胞中表達作為潛在的分子標志物，有希望用于胰腺癌的早期診斷。
我們的研究為尋找胰腺癌的分子標志物提供了一個新的思路，盡管對于篩選的潛在標志物仍需進行大量的生物驗證實驗，但不難發(fā)現(xiàn)微陣列技術(shù)應(yīng)用于癌癥診斷的潛在的分子標志物的篩選和尋找有很大的作用。
關(guān)鍵詞：生物信息學；DNA微陣列技術(shù)；雙向聚類；方差分析；監(jiān)督算法
2.64萬字 64頁 包括外文翻譯，原創(chuàng)作品，通過查重系統(tǒng)
摘 要
胰腺癌是一種相當棘手的人類癌癥，這很大程度上是因為其病情進展迅速且診斷困難，目前用于其診斷的有效的分子標志物尚少發(fā)現(xiàn)。隨著人類基因組計劃的發(fā)展，生物信息學在人類疾病相關(guān)基因的鑒別、基因與蛋白質(zhì)的表達與功能研究等方面都發(fā)揮著重要的作用。尤其在疾病診斷領(lǐng)域，生物基因芯片通過對全組基因表達圖譜進行數(shù)據(jù)挖掘，可以成功地將臨床表征不明或容易誤診的腫瘤準確、快速地區(qū)分開，從而為癌癥的早期診斷與及時治療做出了突出的貢獻。基因微陣列技術(shù)給發(fā)現(xiàn)癌癥早期診斷的分子標志物提供了強大的工具，它能夠在同一個水平上面對大量的基因進行檢測和分析。
胰腺癌中85%的患者是胰腺導管癌，本文便從對胰腺導管癌的基因表達進行分析下手，應(yīng)用了微陣列分析方法，希望從大量的基因微陣列數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)胰腺癌的潛在分子標志物。我們在實驗中對一個含有49個樣本的微陣列數(shù)據(jù)矩陣(其中24個是胰腺導管癌患者，另外25個為正常樣本)應(yīng)用了兩種方法進行分析。首先對樣本應(yīng)用了方差分析法，篩選出來21個具有表達差異的數(shù)據(jù)集，其對應(yīng)的基因可能作為潛在的標志基因；由于其3-D散點圖表明在這個結(jié)果中癌癥和正常細胞之間并不能完全實現(xiàn)精準的區(qū)分，因此我又采用了一種有監(jiān)督的預測算法—WV算法（weighted vote method，WV），在確定五個基因為訓練集對樣本進行預測分析時，預測精準度能達到81.6%，通過這個方法我們得到了11個具有表達差異的數(shù)據(jù)集。通過兩個方法的共同分析，以及對得到的可能的標志基因進行功能查詢，我們最終確定了EPPK1 、SCGB3A1、PLOD2和DKFZp564I1922這四個基因的表達值變化以及其調(diào)控的蛋白質(zhì)在細胞中表達作為潛在的分子標志物，有希望用于胰腺癌的早期診斷。
我們的研究為尋找胰腺癌的分子標志物提供了一個新的思路，盡管對于篩選的潛在標志物仍需進行大量的生物驗證實驗，但不難發(fā)現(xiàn)微陣列技術(shù)應(yīng)用于癌癥診斷的潛在的分子標志物的篩選和尋找有很大的作用。
關(guān)鍵詞：生物信息學；DNA微陣列技術(shù)；雙向聚類；方差分析；監(jiān)督算法
