名貴魚(yú)類的卵黃蛋白原蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及遺傳進(jìn)化分析

1.56萬(wàn)字 40頁(yè) 原創(chuàng)作品，已通過(guò)查重系統(tǒng)


摘 要
卵黃蛋白原(Vg)是一種普遍存在于卵生非哺乳動(dòng)物中的糖磷脂蛋白，是幾乎所有卵生動(dòng)物中的卵黃蛋白(Vn)的前體。因?yàn)閂g的表達(dá)受到雌激素的調(diào)控，所以Vg成為一種廣泛應(yīng)用于監(jiān)測(cè)環(huán)境中雌激素效應(yīng)的生物標(biāo)志物。此外，Vg也被用于檢測(cè)魚(yú)類的生殖能力或疾?。ù菩弁w、性逆轉(zhuǎn)和性腺發(fā)育不完全）。本研究進(jìn)行了不同物種的卵黃蛋白原基因序列的對(duì)比分析和分子進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建，分析了珍稀魚(yú)類卵黃蛋白原的在物種間的進(jìn)化規(guī)律，發(fā)現(xiàn)卵黃蛋白原在進(jìn)化上并不是十分保守，不同物種之間的差異較大。在所比較的物種中，Vg的氨基酸序列的相似性在21% （美洲白鱘和線蟲(chóng)）到82%（鯽魚(yú)和斑馬魚(yú)）之間。根據(jù)卵黃蛋白原基因序列得到的分類結(jié)果與傳統(tǒng)分類結(jié)果類似，系統(tǒng)發(fā)育情況基本吻合。鱘魚(yú)在進(jìn)化關(guān)系上與四足動(dòng)物更為親近，可以推斷出鱘魚(yú)仍然保持著大部分的祖先基因特征以及其整體較慢的進(jìn)化分歧速率。七鰓鰻與其它所有魚(yú)類的親緣關(guān)系都相距很遠(yuǎn)。蛋白質(zhì)三維構(gòu)型預(yù)測(cè)比較分析表明名貴魚(yú)類中的七鰓鰻、虎紋貓鯊、美洲白鱘和藍(lán)鰭金槍魚(yú)的卵黃蛋白原的三維結(jié)構(gòu)都很相似，卵黃蛋白原中Vitellogenin 結(jié)構(gòu)域是Vg全部序列最保守的部分。

關(guān)鍵詞：卵黃蛋白原，名貴魚(yú)類，遺傳進(jìn)化樹(shù)，蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)